Bellamy part seul pendant la nuit à la recherche de la capsule, Octavia le suit et il lui avoue avoir tiré sur le chancelier. Pour la sauver, il doit lui transfuser son sang. Il blâme Monty pour la destruction du mont et la mort de Maya.

Pendant ce temps, dans la navette du camp des 100, Raven, blessée mais en vie, est rejointe par Murphy. À Polis, lors d'une réunion avec les représentants des clans, Lexa affirme son rang en exécutant l'émissaire de la Nation des Glaces. Dante lui avoue n'en rien savoir, car il s'est fait doubler par son fils Cage et le docteur Tsing. Lexa et Clarke font une réunion avec leurs chefs de guerre respectifs. À Arkadia, Jasper est finalement maitrisé et enchainé. Il y a 97 ans, un Armageddon nucléaire a décimé la planète Terre, détruisant la civilisation. Thelonius et les trois autres tentent de suivre en mer la direction du drone, désormais disparu, et voient à leur grand soulagement le halo d'un phare. Plus tard, elle contraint Murphy à lui faire l'amour. Mais l'IA avait placé un espion parmi les prisonniers, qui sont repris et crucifiés ; elle envoie aussi Emori vers les trois rebelles pour les arrêter. Octavia se réveille dans une grotte où le Natif l’a emmené. Elle décide de s'évader. Finn émet des regrets et fait comprendre à Clarke qu'il sera hanté à jamais par ses actes. Jasper, dans son désespoir et sa colère, finit par franchir une limite de façon inacceptable, malgré les efforts de Monty qui tente tant bien que mal de récupérer son meilleur ami. Kane décide de faire un premier pas vers la paix, jette ses armes puis délivre son prisonnier.
Il lui expose la situation et les liens qui l'unissent à Ontari, avant d'être appelé auprès du Commandeur et de la quitter. Cependant, Bellamy emprisonne Clarke mais sa sœur intervient et la libère. Raven renvoie Clarke et Jasper face à leur démons et leur faiblesses (Morts de Wells, Finn, Lexa et son père pour Clarke, mort de Maya pour Jasper). Elle l'assomme et l'enchaîne dans une grotte sous la surveillance d'Indra. Il est emprisonné dans la tour où elle le rejoint et feint d'être prisonnière et inquiète pour sa fille. Clarke s'interpose et le supplie de ne pas le faire, une partie de son esprit étant toujours en partie dedans. En le nettoyant de la terre qui s'était accumulée, il alimente de nouveau le phare en énergie, et entend une musique provenant de l'intérieur. Sinclair succombe à ses blessures. Bellamy est prévenu d'une menace imminente contre le sommet grâce à Echo, une Native qu'il avait aidée à s'évader du Mont Weather.

Le conseil de l'Arche commence à débattre du fait que plus de 200 personnes devront être tuées pour que l'Arche puisse survivre encore six mois. Elle ramène Clarke avec elle pour négocier avec Bellamy et le ramener à la raison ainsi que Pike et leur montrer que la guerre n'est pas la solution. Clarke quant à elle a réussi à s'échapper mais tombe sur un piège dans la forêt. Deux Skaikru sont tués et les terres convoitées deviennent infertiles. Elle atterrit dans les ruines d'une cité qui deviendra Polis et elle le Premier Commandant. Finn la suit et convainc Lincoln d’arranger une rencontre avec la leader des terriens, Anya, pour qu’ils fassent la paix.

Abby organise alors une expédition pour détruire le brouilleur mais ils sont stoppés par le brouillard. Les évadés quittent l'enceinte d'Arkadia tandis que Pike prend des mesures après avoir compris que les rebelles écoutaient les transmissions. Clarke et Raven partent à la recherche d’un transmetteur pour pouvoir fabriquer une radio au refuge souterrain. Démasqué par Bellamy, le bras droit de Lexa reconnaît avoir empoisonné la coupe. Clarke ne veut pas laisser de nouveau Lexa et lui dit qu’elle l'aime. Les Natifs sont soumis à la loi d'ALIE 1 et tous ceux qui refusent de prendre la pilule sont condamnés à mort notamment par crucifixion.

Une fois la chasse au sniper terminée, l'alliance Natifs / Peuple du ciel marche vers la montagne en laissant les blessés entre les mains de la Chancelière Abby. Dans la salle ou sont enfermés Jasper et son compagnon Derrick, Luna est torturée afin d'accepter de prendre la clef.

D’un autre côté, Murphy, Pike et Indra sauvent Bellamy et les autres des hommes d’ALIE. Il décide de s'en approcher, mais heurte un panneau solaire. Murphy retrouve Emori, tandis qu'Abby réconforte Kane.

Poussée par sa culpabilité, Charlotte avoue alors que c'est elle la coupable. Pour protéger Octavia, Lincoln se blesse en prenant une flèche venant de son propre camp. L'armée de maintien de la paix de Lexa s'est fait tuer durant son sommeil par Pike et ses hommes.
Pour protéger les secrets de la mission, ils essaient de tuer un enfant Natif mais Octavia l'aide à se cacher. Jasper se réconcilie avec Monty, Raven et Harper.

Finn, déçu, part dans le bunker suivit de Clarke.